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2016年度中国高校编辑出版质量优秀科技期刊

“安徽省科技期刊编校质量奖”优秀奖

第六届华东地区优秀期刊奖（2017年）

优秀高校学报(期刊)（2017年）

“十佳皖版期刊” （2018年）

中国高校优秀科技期刊（2018年）

中国高校优秀科技期刊（2020年）

“基础医学研究”栏目被评选为华东地区期刊“优秀栏目”（2020年）

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