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胃萎缩性炎症恶变过程中基因表达谱的变化

安徽医科大学学报 2019 03 v.54 402-407     字体:

基金项目: 安徽省自然科学基金(编号:1808085MH304);;安徽省公益性技术应用研究联动计划项目(编号:1604f0804018)

作者:丁西平;毛玉娣;汪朝靓;周欢;程前;

关键词:炎症恶化;;胃癌;;萎缩性胃炎;;基因表达谱;;GO分析;;KEGG信号通路;;PPI网络分析

DOI:10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2019.03.013

〔摘 要〕 目的研究胃萎缩性炎恶变至胃癌过程中基因表达谱的变化。方法收集5例重度萎缩胃炎伴肠上皮化生组织和5例进展期胃癌组织进行基因芯片检测,筛选差异性表达的基因。通过生物信息学分析的方法对差异性表达的基因富集的生物过程、信号通路、基因编码蛋白之间相互关系进行分析。结果通过基因芯片检测,筛选出2 779个差异性表达的基因,并对变化最明显的前15个上调及前15个下调的基因进行总结,其中包括CPA2、HCAR3、BCL2A1、ITGAX等新发现的胃癌相关基因。此外,生物信息学分析显示了差异性表达基因所代表的生理意义,如炎症反应、细胞迁移、TNF信号通路、NF-kappa B信号通路、Toll样受体信号通路、趋化因子信号通路等。结论萎缩性胃炎恶变至胃癌过程中基因表达谱发生明显变化,并代表了相应的生理意义。