基金项目: 江西省重点研发计划项目(编号:20203BBG73056);;江西省主要学科学术和技术带头人培养计划-领军人才项目(编号:20213BCJ22014);;国家自然科学基金(编号:8216100399)
作者:卢豪;范纪昌;周立强;吴忧;辛林;
关键词:HNF4A;;胃癌;;细胞增殖;;生物信息学
DOI:10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2023.03.015
〔摘 要〕 目的探讨肝细胞核因子4A(HNF4A)在胃癌中的表达、预后及生物学作用,并研究其对胃癌细胞增殖的影响。方法肿瘤免疫分析2.0(TIMER2.0)和基因表达谱交互式分析(GEPIA2)数据库分析HNF4A在胃癌和正常组织中的表达差异,KM plotter分析HNF4A表达水平与胃癌患者生存率的相关性,TISIDB数据库和R语言4.1.2分析HNF4A是否参与胃癌免疫调节的过程,cBioPortal数据库分析HNF4A在胃癌中的突变情况,GSEA 4.2对HNF4A进行功能富集分析,LinkedOmics数据库预测HNF4A可能调控的基因。实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR)、蛋白质印迹法(Western blot)和免疫组织化学(IHC)染色检测HNF4A在胃癌和癌旁组织中的相对表达量,细胞计数试剂盒-8(CCK-8)、5-乙炔基-2′-脱氧尿苷(EdU)、平板克隆和流式细胞周期检测胃癌细胞的增殖和细胞周期。结果HNF4A在胃癌组织中表达升高(P<0.05),HNF4A高表达胃癌患者总生存率更差(P<0.001)。HNF4A在胃癌中主要以错义突变为主。免疫细胞浸润发现HNF4A和B淋巴细胞、CD8+T细胞、中性粒细胞、巨噬细胞和树突状细胞都相关(P<0.001),HNF4A还和肿瘤突变负荷(r=0.28,P<0.0001)、微卫星不稳定性(r=0.13,P<0.01)相关。敲低HNF4A后,胃癌细胞的增殖能力明显减弱,诱导其细胞周期阻滞在G0/G1期。结论HNF4A在胃癌组织中表达明显升高,并且与预后不良相关,还可能参与免疫调节过程,敲低HNF4A可以抑制胃癌细胞增殖。