〔摘　要〕 目的 采用16S rDNA测序技术比较慢性牙髓炎和慢性根尖周炎患牙根管内微生物群落的构成差异，了解微生物与牙髓疾病的关系。方法 临床采集需要进行根管治疗的慢性牙髓炎患牙和慢性根尖周炎患牙根管内微生物群落样本。提取样本中的细菌总DNA,PCR扩增其16S rDNA片段上的V3-V4高变区基因片段，经NovaSeq测序后进行统计分析和生物信息学分析，包括种系发育分析、多样性分析及组间差异分析。结果 总计收集到慢性牙髓炎患牙6颗，慢性根尖周炎7颗，经高通量测序后共得到8 510个操作分类单元(OTU),菌群多样性分析显示慢性牙髓炎和慢性根尖周炎在菌群构成的差异有统计学意义(P<0.05)。其中，变形菌门、酸杆菌门及放线菌门在慢性牙髓炎患牙根内相对丰度显著高于慢性根尖周炎。拟杆菌门和互养菌门的相对丰度在慢性根尖周炎患牙根管中显著增加。结论 牙髓疾病患牙根管中感染微生物存在复杂多样性。慢性牙髓炎和慢性根尖周炎感染根管内的微生物群落构成上具有一定差异，根管内微生物组成的变化可能与牙髓疾病发生发展相关。