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动物双歧杆菌B4株的全基因组测序及其益生特性分析

安徽医科大学学报     字体:

基金项目: 国家自然科学基金青年基金项目(编号:82302568);江西省教育厅科学技术研究项目——一般项目(编号:GJJ2203414); 安徽省自然科学基金青年项目(编号:2308085QH283);安徽省教育厅青年骨干教师境内访学研修资助项目(编号:gxjnfx2023003); 安徽医科大学大学生创新创业项目(编号:202310366054);

作者:丁瑞培;刘承忠;史灿灿;张慧玉;代宜萍;穆如雪;李子龙;何茂章;李卓君

关键词:动物双歧杆菌;分离培养;全基因组测序;基因组分析;益生菌;益生基因;

DOI:10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2025.02.010

〔摘 要〕 目的 分析由健康人粪便中新分离出的一株动物双歧杆菌B4株的全基因组信息,并探究其益生特性。方法 采用体外实验方法对动物双歧杆菌B4的耐药性、溶血性、耐胃酸特性以及生化特性进行评估,并利用二代+三代测序技术对该菌进行全基因组测序以及基因功能注释。结果 经全基因组测序后显示该动物双歧杆菌B4株基因组大小为1 944 146 bp,GC含量为60.49%,不含质粒,总基因数为1 642个。体外实验分析结果显示,该动物双歧杆菌B4株具有良好的益生特性,包括非溶血性和耐胃酸的特性。同时基因组结果显示,该动物双歧杆菌B4株不具有毒素、致病相关基因,耐药基因少且传播能力不高,具有很高的安全性。通过KEGG、COG、GO等基因注释显示其含有很多生物活性酶,如β-半乳糖苷酶、L-乳酸脱氢酶等益生基因。结论 该动物双歧杆菌B4株具有良好的益生特性,在基因层面上展示了优良的安全性,具有益生特性的基因序列。