• 《中文核心期刊要目总览》收录期刊
  • 《科技期刊世界影响力指数(WJCI)报告》入选期刊        
  • 美国《化学文摘(网络版)》收录期刊        
  • 美国《剑桥科学文摘社生命科学文摘数据库》收录期刊
  • 美国《剑桥科学文摘社ProQeust数据库》收录期刊
  • 《全球公共卫生数据库》收录期刊
  • 《日本科学技术振兴机构数据库2024》收录期刊
  • 安徽省“精品栏目”期刊(2022年)       
  • 中国高校科技期刊建设示范案例库优秀科技期刊(2022年)
  • 安徽省“十佳科技期刊” (2023年)

原发性干燥综合征免疫原性细胞死亡关键基因筛选与验证

安徽医科大学学报     字体:

基金项目: 贵州中医药大学大学生创新创业训练计划项目(编号:贵中医大创合字[2023]06号);贵州省科技计划项目(编号:黔科合基础-ZK[2023]一般408);贵州中医药大学第二附属医院“三航”人才培养工程科研人才项目(编号:SHRC-KY2024002);贵州省高等学校重点实验室建设项目(编号:黔教技[2023]017号);

作者:郝婉婷;吴文凤;侯雷;马武开;杨鹏

关键词:原发性干燥综合征;免疫原性细胞死亡;免疫细胞浸润;CD8+T细胞亚群;DDX58;IFIH1;CASP1;IFNG;

DOI:专辑:医药卫生科技

〔摘 要〕 目的 利用多组学数据,系统筛选并验证在原发性干燥综合征(pSS)中发挥重要作用的关键免疫原性细胞死亡(ICD)基因。方法 从基因表达数据库(GEO)中获取pSS患者(131例)与健康对照(29例)的基因表达谱(GSE66795),将其与已知的ICD核心基因集及pSS相关靶点取交集,筛选候选基因。运用CIBERSORT算法分析样本的免疫细胞浸润特征;结合分选CD8+T细胞亚群的转录组数据(GSE93683)进行表达验证。最后,收集10例pSS患者及4名健康对照的唇腺组织和外周血样本,通过RT-qPCR对关键基因进行实验验证。结果 共筛选出7个ICD差异表达基因与pSS交集基因[胱天蛋白酶(CASP1)、叉头框蛋白P3(FOXP3)、干扰素γ(IFNG)、髓样分化因子88(MYD88)、Toll样受体7(TLR7)、DExD/H盒螺旋酶58(DDX58)和干扰素诱导解旋酶C结构域1(IFIH1)]。免疫浸润分析显示,pSS唇腺组织中初始B细胞与树突状细胞比例显著升高,静息NK细胞及M0巨噬细胞比例降低(P<0.05)。CD8+T细胞亚群转录组数据表明,IFIH1在中央记忆型CD8+T细胞中表达显著升高(P<0.05)。RT-qPCR实验验证显示,DDX58、IFIH1、CASP1在pSS外周血白细胞及唇腺组织中表达均上调(均P<0.05),IFNG在外周血中表达升高而在唇腺中表达降低(P<0.05)。结论 本研究通过生物信息学与实验验证相结合的方法,筛选并证实了DDX58、IFIH1、CASP1、IFNG是pSS中关键的ICD相关基因,为深入理解pSS的免疫病理机制提供了新的候选靶点。