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基于转录组测序的ATPR诱导NB4细胞分化过程中lncRNA的初步鉴定与分析

安徽医科大学学报 2021 06 v.56 915-919     字体:

基金项目: 安徽省科技重大专项项目(编号:17030801020);;安徽省高校自然科学研究项目(编号:KJ2019A0272)

作者:冯钰斌;胡爽;李兰兰;徐小玲;张梅菊;彭晓清;陈飞虎;

关键词:ATPR;;NB4细胞;;基因芯片技术;;lncRNA

DOI:10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2021.06.015

〔摘 要〕 目的为了探究新型维甲酸衍生物4-氨基-2-三氟甲基苯基维甲酸酯(ATPR)诱导人急性早幼粒细胞白血病NB4细胞分化的潜在作用机制。方法分别用ATPR和全反式维甲酸(ATRA)诱导NB4细胞分化,然后用基因芯片技术对处理后的细胞进行长链非编码RNA (lncRNA)和mRNA表达谱分析。结果与ATRA组比较,有775个lncRNA和904个mRNA在ATPR组被筛选出,且顺式调控基因分析了一些关键lncRNA的染色体定位。反式分析结果表明相关转录因子能调节lncRNA的表达。结论 lncRNA在ATPR诱导NB4细胞分化过程中起到重要的调节作用。