基金项目: 国家自然科学基金(编号:31800985);;山东省医药卫生科技发展计划项目(编号:2017WS694);;烟台市科技创新发展计划基础研究类项目(编号:2023JCYJ072);;滨州医学院科研启动基金(编号:BY2017KYQD09)
作者:吴晓俊;倪飞雪;徐玉雪;
关键词:糖尿病肾病;;GEO数据库;;转录组;;生物信息学;;基因筛选;;药物靶点
DOI:10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2024.04.009
〔摘 要〕 目的 基于生物信息学筛选糖尿病肾病(DKD)核心基因,探究DKD的治疗靶点,讨论其可能的调控机制。方法提取GEO数据库(GSE30528,GSE47183)DKD患者肾小球转录组表达数据矩阵,采用生物信息学方法对差异表达基因(DEGs)进行筛选,鉴定出核心差异基因,对核心差异基因进行基因表达与富集分析(GSEA),预测有效靶点。结果 通过对DKDmRNA表达矩阵的筛选和鉴定,共筛选出5个核心基因,其中C1orf21、NPHS1表达显著下调,CD48、COL1A2、TGFBI表达上调,研究得知,NPHS1、CD48与免疫差异、细胞间交流及细胞表面相互作用等有显著相关性。通过受试者工作特征曲线(ROC)分析、GSEA分析及药物靶点与miRNA预测显示,这些差异基因可能对DKD的治疗具有重要意义。结论 该研究筛选的核心基因与DKD具有显著相关性,有可能作为糖尿病治疗有效标志物,为DKD的治疗与鉴定提供理论依据。