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BGC823中ND5基因突变对其蛋白影响的生物信息预测

安徽医科大学学报 2019 01 v.54 74-78     字体:

基金项目: 内蒙古自治区高等学校科学研究项目(编号:NJZC16109);;内蒙古医科大学本科教学质量工程项目(编号:NYJTXX201712);内蒙古医科大学本科教学改革项目(编号:NYJXGG2018038);内蒙古医科大学实验室开放基金项目(编号:2015ZN17);内蒙古医科大学博士启动基金(编号:YKD2015BQ03);;内蒙古自然科学基金项目(编号:2015MS0888)

作者:李恋;沈晓玲;张明昱;包丽丽;纳仁高娃;

关键词:BGC823;;ND5蛋白;;错义突变;;生物信息预测

DOI:10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2019.01.015

〔摘 要〕 目的分析总结胃癌细胞BGC823中ND5基因突变,利用生物信息学方法分析比较正常和突变的ND5蛋白的结构和功能。方法从胃癌细胞BGC823中扩增ND5基因,分析蛋白错义突变的位点,通过Prot Param、TMHMM、PredictProtien、Swiss-Model、Swiss-Pdb Viewer等生物软件分析比较正常和突变的ND5蛋白理化性质、跨膜区、二级及三级结构等。结果胃癌细胞BGC823的ND5蛋白有两处错义突变位点。突变后的ND5蛋白不稳定系数升高,螺旋区分布和蛋白结合位点与正常ND5蛋白不同,三级结构分析显示167位点突变后形成了新的氢键。结论 BGC823中的突变位点对ND5蛋白的理化性质、二级结构、三级结构有影响。