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16S rRNA序列分析技术对临床标本中疑难细菌的鉴定

安徽医科大学学报 2015 07 v.50 1000-1003     字体:

基金项目: 安徽省高校省级自然科学研究项目(编号:KJ2010A174)

作者:叶乃芳;凌华志;黄颖;沈继录;徐元宏;王中新;

关键词:16S rRNA基因;;序列分析;;细菌;;鉴定

DOI:10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2015.07.030

〔摘 要〕 目的应用16S rRNA序列分析技术鉴定临床少见或疑难细菌,提高细菌鉴定的准确性。方法收集临床少见或疑难细菌44株,提取DNA,采用通用引物进行PCR扩增及目的片段基因测序,并将测序结果在核酸数据库中比对分析以确定菌种。结果 44株临床少见或疑难细菌均扩增到16S rRNA目的基因片段并成功测序,40株(90.9%)鉴定到"种",4株(9.1%)鉴定到"属";其中常规方法与测序方法在"属"水平一致的有34株(77.3%),不一致的有10株(22.7%)。结论 16S rRNA序列分析技术可以准确、快速地鉴定临床少见或疑难细菌,可以作为临床细菌鉴定的重要方法之一。