〔摘　要〕 目的 探讨基于宏基因组第二代测序技术(mNGS)在综合重症病房(ICU)疑似中枢神经系统(CNS)感染患者中的应用价值，为综合ICU患者CNS感染的快速精准诊断提供参考。方法 收集行脑脊液mNGS检测的患者资料82例，根据纳入标准，取52例疑似CNS感染、同时有送检脑脊液常规、生化、培养和mNGS检测结果的患者进行最终数据分析，以临床诊断CNS感染为“金标准”,比较传统检测和mNGS检测两种方法检出率差异及相对于“金标准”的应用价值。结果 52例患者中，最终CNS感染患者32例，其中24例脑脊液mNGS阳性，5例脑脊液培养阳性，两种方法的灵敏度、特异度分别为75.00%vs 15.63%、55.00%vs 95.00%,阳性、阴性预测值分别为72.73%vs 83.33%、57.89%vs 41.00%;两种方法检出率差异无统计学意义(P>0.05)。32例CNS感染中，细菌性感染14例，病毒性感染9例，真菌性感染2例以及其他感染7例，其中mNGS检测病毒感染病原体灵敏度66.70%,特异度95.30%,阳性预测值为75.00%,阴性预测值为93.20%,与临床最终诊断金标准间具有高度一致(Kappa值=0.649,P<0.01)。结论 脑脊液mNGS对于中枢病毒感染相较于细菌感染具有更高的诊断准确率，建议采用mNGS检测对疑似中枢病毒感染的患者进行快速筛查。