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三种细菌HPI核心区ybtE基因核苷酸序列及推导氨基酸序列的比较研究

安徽医科大学学报 2008 03 244-247     字体:

基金项目: 国家重点基础研究发展规划项目(编号:G1999054101);; 安徽省教育厅自然科学基金(编号:2005kj247)

作者:张冬梅;王斌;

关键词:大肠杆菌/遗传学;;毒力;;序列分析;;基因,细菌

DOI:10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2008.03.002

〔摘 要〕 目的比较三种肠聚集性大肠埃希菌、小肠结肠炎耶尔森菌和鼠疫耶尔森菌HPI毒力岛核心区ybtE基因的同源性。方法PCR扩增肠聚集性大肠埃希菌(EAEC)17-2ybtE基因的完整序列,克隆后测序。用ABIPRISM软件对该ybtE基因序列与已知的鼠疫耶尔森菌HPI的ybtE基因以及小肠结肠炎耶尔森菌HPI的irp5基因进行核苷酸序列和推导氨基酸序列比较。结果核苷酸序列,EAEC17-2与鼠疫耶尔森菌及小肠结肠炎耶尔森菌之间的同源性分别为99.8%和98.2%,鼠疫耶尔森菌与小肠结肠炎耶尔森菌之间的同源性为98.2%;推导氨基酸序列,EAEC17-2与鼠疫耶尔森菌及小肠结肠炎耶尔森菌之间的同源性分别为99.8%和97.6%,鼠疫耶尔森菌与小肠结肠炎耶尔森菌之间的同源性为97.8%。结论ybtE基因作为HPI的功能基因高度保守,EAEC中的HPI可能来源于YpsHPI。