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基于H4C6甲基化水平和cfDNA浓度构建多癌种癌症风险预测模型

安徽医科大学学报 2023 04 v.58 597-603     字体:

基金项目: 国家自然科学基金(编号:81872438);;中国科学院合肥物质科学研究院院长基金青年“火花”项目(编号:YZJJ2022QN43)

作者:胡玉莲;齐健;王姝洁;洪波;孙晓君;王宏志;聂金福;

关键词:H4C6甲基化水平;;cfDNA浓度;;癌症风险预测

DOI:10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2023.04.013

〔摘 要〕 目的 探究H4聚簇组蛋白6(H4C6)甲基化水平和循环游离DNA(cfDNA)浓度在正常组与肿瘤组之间的差异;基于H4C6甲基化水平和cfDNA浓度构建癌症风险预测模型并评估模型的预测性能。方法 使用磁珠法提取血液样本中的cfDNA;使用Qubit 4.0荧光定量仪检测cfDNA浓度;利用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术检测cfDNA的H4C6甲基化水平;使用Logistic回归算法构建H4C6甲基化水平联合cfDNA浓度的癌症风险预测模型;使用受试者工作特征(ROC)曲线和校准曲线评估模型的准确性;使用决策曲线分析(DCA)评估模型的临床效益。结果 联合H4C6甲基化水平与cfDNA浓度构建的模型区分肺癌、肝癌、结直肠癌、胃癌、泛癌与健康组的ROC曲线下面积(AUC)分别为0.769、0.988、0.934、0.922、0.830;校准曲线的平均绝对误差小于0.05;DCA曲线的净收益大于0。结论 基于H4C6甲基化水平和cfDNA浓度构建的癌症风险预测模型有较好的预测性能,有助于给临床前决策提供合理且有效的建议,最终可能给患者提供有针对性的、个性化的癌症检测与诊断方案。