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ATF3与Smad4在翼状胬肉中的表达及相互作用

安徽医科大学学报     字体:

基金项目: 国家自然科学基金(编号:82060171);

作者:华耘;韩欢欢;陈冬梅;刘佳琳;赵新荣

关键词:翼状胬肉;ATF3;Smad4;相互作用;初步探究;

DOI:10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2025.06.013

〔摘 要〕 目的 初步探究转录激活因子3(ATF3)与Smad家族成员4(Smad4)在翼状胬肉中的表达及其相互作用。方法 通过生物信息学方法来分析NCBI数据库中的两套数据集GSE51995和GSE2513,筛选出以正常结膜作为对照时,翼状胬肉的关键差异表达基因ATF3。并通过实时荧光定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)进一步检测生物信息学分析找出的差异基因。最后结合文献查找并通过基因转录调控数据库(GTRD)预测是否存在可能与目标基因结合的靶基因Smad4,RT-qPCR验证Smad4在正常结膜与翼状胬肉组织中的表达情况,并通过免疫共沉淀(Co-IP)探究ATF3与Smad4蛋白在翼状胬肉中是否存在相互作用。结果 生物信息学分析结果显示,以正常结膜组织为对照,翼状胬肉组织中存在有显著性差异的低表达基因ATF3(P <0.05)。RT-qPCR实验显示,与正常结膜组织相比,ATF3在翼状胬肉组织中低表达(P <0.001)。数据库(GTRD)中检索出Smad4基因与ATF3有两个结合位点,提示可能与ATF3存在相互作用。与正常结膜相比,RT-qPCR显示翼状胬肉组织中Smad4表达下调(P <0.01),Co-IP结果显示,在使用ATF3抗体进行免疫沉淀时,翼状胬肉组织中Smad4结合量增加(P <0.05)。结论 ATF3与Smad4在翼状胬肉中存在相互作用,二者在翼状胬肉组织中的低表达及其相互作用可能与翼状胬肉的发病相关。