〔摘　要〕 目的 探讨宏基因组二代测序(mNGS)对肺部感染患者病原学检测的应用价值。方法 回顾性分析近4年收治的434例肺部感染患者资料，根据有无基础疾病，分为基础疾病组(n=262)和无基础疾病组(n=172)。分别采用mNGS和常规检测获取各组患者的病原菌，分析患者的临床及实验室资料、影像学资料及病原菌检测结果，比较两种检测方法对肺部感染病原菌的诊断效能。结果 434例患者mNGS检出阳性率高于常规检测，差异有统计学意义(P＜0.05)。mNGS检出细菌、病毒效能明显高于常规检测，差异有统计学意义(P<0.05)；而mNGS真菌检出率虽高于常规检测，但差异无统计学意义。其中结核分枝杆菌、肺炎支原体、流感嗜血杆菌、肺炎链球菌、星座链球菌及金黄色葡萄球菌、烟曲霉检出率明显高于常规检测，差异有统计学意义(P<0.05)。亚组分析显示，基础疾病组的男性比例、住院时间、吸烟率及平均年龄均高于无基础疾病组，差异有统计学意义(P<0.05)，而两组抗生素使用及气管插管率差异无统计学意义。mNGS检出基础疾病组最常见病原菌为结核分枝杆菌、流感嗜血杆菌、肺炎链球菌、铜绿假单胞菌、人类疱疹病毒4型及烟曲霉，无基础疾病组最常见病原菌为结核分枝杆菌、流感嗜血杆菌、肺炎链球菌、肺炎支原体及肺炎克雷伯菌。两组mNGS阳性率均显著高于常规检测，差异有统计学意义( P<0.05)，而两组mNGS阳性率对比差异无统计学意义。结论 mNGS在肺部感染病原菌检测中较常规检测具有显著优势，受基础疾病的影响小，可为肺部感染提供病原学依据。