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DCX过表达胶质瘤细胞中差异基因的生物信息学分析

安徽医科大学学报 2025, 12, v.60 2247-2254     字体:

基金项目: 国家自然科学基金项目(编号:82273250)~~

作者:周玲欣;Iqra Nadeem;秦玉侠;熊晔;

关键词:胶质瘤; 双皮质素; 差异表达基因; 生物信息学; 富集分析; 转录组测序;

DOI:10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2025.12.007

〔摘 要〕 目的 探究双皮质素(DCX)在胶质瘤中的作用机制,筛选DCX过表达相关差异基因,为胶质瘤靶向治疗提供新靶点。方法 以大鼠胶质瘤细胞C6为靶细胞,构建LV-DCX-EGFP、LV-Cas9-Puro和LV-Ctrl-EGFP慢病毒,经Cas9双载体系统转染、筛选建立DCX过表达及对照C6细胞系。利用转录组测序获取差异基因表达谱,通过iDEP、DESeq2筛选差异基因(|Log2(FC)|>2,P0.7,具有良好的诊断价值。RT-qPCR验证部分上调基因POU2F3、LPAR6、SREBF1 mRNA表达显著升高(P