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横纹肌肉瘤中融合基因阳性和阴性细胞功能学及差异miRNA生物信息学分析

安徽医科大学学报 2020 12 v.55 1828-1832     字体:

基金项目: 国家自然科学基金(编号:81660441、81960485)

作者:王晓萌;李真真;孟莲;张海俊;党鸿蔚;李锋;刘春霞;

关键词:横纹肌肉瘤;;侵袭;;迁移;;凋亡;;miRNA;;生物信息学

DOI:10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2020.12.003

〔摘 要〕 目的比较横纹肌肉瘤(RMS)融合基因阳性和阴性细胞的生物学行为,结合生物信息学分析差异miRNA,并在RMS细胞中验证筛选差异miRNA的表达。方法分别利用CCK-8、Transwell、流式细胞术检测RMS中融合基因阳性RH30细胞和融合基因阴性RD及PLA-802细胞的增殖、侵袭、迁移和凋亡能力;利用GEO2R分析融合基因阳性和阴性细胞的差异miRNA;利用Sangerbox绘制差异miRNA火山图,运用qRT-PCR验证筛选的差异miRNA。结果RD细胞的增殖能力高于RH30细胞和PLA-802细胞(P<0.05)。RH30细胞的侵袭、迁移和抗凋亡能力高于PLA-802细胞和RD细胞(P<0.05)。火山图结果显示上调miRNA(红色)多于下调miRNA(绿色)(P<0.05)。根据|log2FC|>3,P<0.05筛选得到12个差异miRNA(上调miRNA:miR-1、let-7d-5p和let-7b-5p,下调miRNA:miR-196a-5p、miR-455-3p、miR-21-5p、miR-193a-3p、miR-29b-3p、miR-29a-3p、miR-100-5p、miR-222-3p和miR-221-3p),qRT-PCR检测12个差异miRNA的表达,其结果与生物信息学分析结果一致。结论RMS融合基因阳性细胞的侵袭、迁移、抗凋亡能力高于融合基因阴性细胞,融合基因阳性与阴性组间差异miRNA为RMS研究提供新的方向。