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基于多数据库分析FAM72A在肝癌中的表达及意义

安徽医科大学学报 2020 07 v.55 1111-1117     字体:

基金项目: 湖北省卫生健康委员会联合基金项目(编号:WJ2019H104)

作者:萧正康;马丹丹;李中虎;张智勇;蔡逊;

关键词:肝癌;;FAM72A;;数据库挖掘;;预后

DOI:10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2020.07.025

〔摘 要〕 目的基于多数据库探讨FAM72A在肝癌中的表达差异及临床意义。方法利用HPA数据库分析FAM72A在人正常组织表达概况和FAM72A在肿瘤细胞中的定位。采用GEPIA和Oncomine数据库分析FAM72A在人肝癌组织与人正常肝组织间的表达差异。利用LinkedOmics平台分析FAM72A表达量与肝癌患者临床病理特征的关系。Kaplan-Meier Plotter平台分析FAM72A表达与患者预后的关系。联合cBioPortal和STRING数据库构建FAM72A在肝癌中的共表达分子调控网络,并使用DAVID平台进行共表达基因的KEGG通路富集分析和GO生物途经富集分析。结果 FAM72A在人体正常肝组织中低表达,在肿瘤细胞中主要定位于囊泡、细胞膜及细胞质中。FAM72A在肝癌组织中表达高于正常肝组织(P<0.05)。FAM72A表达量与患者年龄(P=0.006 8)、病理分期(P=0.018)、T分期(P=0.022)、人种(P=0.034)相关。FAM72A高表达组患者与低表达组患者相比预后更差(P=0.000 12)。FAM72A在肝癌中的共表达基因集主要参与DNA转录、DNA转录的调控、细胞分裂、细胞核分裂等过程(FDR<0.05)。KEGG通路富集分析显示这些基因参与了细胞周期、RNA转运、剪接体、DNA复制、P53信号通路、碱基切除修复等相关通路(FDR<0.05)。构建了肝癌中FAM72A高度相关共表达分子的调控网络。结论 FAM72A在肝癌组织中高表达,且高表达FAM72A患者的预后较差。FAM72A表达量与人种、年龄、病理分期相关,有望成为肝癌靶向治疗的新靶点和判断肝癌预后的新标志物。