• 《中文核心期刊要目总览》收录期刊
  • 《科技期刊世界影响力指数(WJCI)报告》入选期刊        
  • 美国《化学文摘(网络版)》收录期刊        
  • 美国《剑桥科学文摘社生命科学文摘数据库》收录期刊
  • 美国《剑桥科学文摘社ProQeust数据库》收录期刊
  • 《全球公共卫生数据库》收录期刊
  • 《日本科学技术振兴机构数据库2024》收录期刊
  • 安徽省“精品栏目”期刊(2022年)       
  • 中国高校科技期刊建设示范案例库优秀科技期刊(2022年)
  • 安徽省“十佳科技期刊” (2023年)

利用基因表达芯片探索多发性硬化的关键基因和通路

安徽医科大学学报 2019 07 v.54 1009-1015     字体:

基金项目: 国家自然科学基金(编号:81260188、81460194);;广西自然科学基金(编号:2012GXNSFAA053082、2015GXNSFAA139212)

作者:黄帆;唐玉兰;廖韦静;邝慧敏;蓝岚;

关键词:多发性硬化;;基因芯片;;差异表达基因;;生物标志物

DOI:10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2019.07.002

〔摘 要〕 目的以GEO数据库中GSE21942系列芯片数据为分析对象,分析多发性硬化(MS)中的高通量基因表达来获得差异表达的基因,筛选出与多发性硬化相关的关键基因和通路。方法利用R语言与DAVID、STRING等方法对差异表达的基因进行GO和KEGG富集分析,构建和分析蛋白质-蛋白质相互作用网络。结果 88个基因被鉴定为差异表达的基因,其中76个基因(86.4%)上调,12个基因(13.6%)下调。Pathway通路分析显示,差异表达基因主要与造血细胞谱系、B细胞受体信号通路、破骨细胞分化、氮代谢等有关,进一步分析筛选出ALAS2、CA1、SNCA、HBB、IL8等核心基因,这些基因在血红素生物合成、突触传递、神经退行性疾病、血脑屏障破坏等生物功能中起重要作用。结论与健康人相比,多发性硬化样本中相关靶基因表达有较大差异,这些数据可能为多发性硬化相关的发病机制和临床治疗提供新思路。