基金项目: 国家自然科学基金(编号:81260188、81460194);;广西自然科学基金(编号:2012GXNSFAA053082、2015GXNSFAA139212)
作者:黄帆;唐玉兰;廖韦静;邝慧敏;蓝岚;
关键词:多发性硬化;;基因芯片;;差异表达基因;;生物标志物
DOI:10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2019.07.002
〔摘 要〕 目的以GEO数据库中GSE21942系列芯片数据为分析对象,分析多发性硬化(MS)中的高通量基因表达来获得差异表达的基因,筛选出与多发性硬化相关的关键基因和通路。方法利用R语言与DAVID、STRING等方法对差异表达的基因进行GO和KEGG富集分析,构建和分析蛋白质-蛋白质相互作用网络。结果 88个基因被鉴定为差异表达的基因,其中76个基因(86.4%)上调,12个基因(13.6%)下调。Pathway通路分析显示,差异表达基因主要与造血细胞谱系、B细胞受体信号通路、破骨细胞分化、氮代谢等有关,进一步分析筛选出ALAS2、CA1、SNCA、HBB、IL8等核心基因,这些基因在血红素生物合成、突触传递、神经退行性疾病、血脑屏障破坏等生物功能中起重要作用。结论与健康人相比,多发性硬化样本中相关靶基因表达有较大差异,这些数据可能为多发性硬化相关的发病机制和临床治疗提供新思路。