基金项目: 国家自然科学基金(编号:81960892)
作者:冷安明,杨静,张葵
关键词:慢性阻塞性肺疾病;桑色素;网络药理学;MMP9;炎症反应
DOI:10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2023.12.001
〔摘 要〕 目的 探讨桑色素通过调控基质金属蛋白酶9(MMP9)对慢性阻塞性肺疾病(COPD)动物和细胞模型的影响。方法 运用SwissTargetPrediction数据库预测桑色素的基因靶点;GeneCards、OMIM及DisGenet数据库对COPD的风险基因进行预测并且借助Venny在线网站对COPD相关基因靶点和桑色素基因靶点取交集;利用String数据库完成蛋白质互作用(PPI)分析并借助Cytoscape 3.8.2软件完成拓扑学分析;借助分子对接技术对药物成分-基因靶点的对接情况进行验证;构建COPD大鼠模型并且验证桑色素对COPD大鼠模型的治疗作用;构建COPD细胞模型并且干预细胞中MMP9的表达;流式细胞术检测细胞凋亡率;ELISA检测炎性因子浓度。结果 SwissTargetPrediction数据库预测得到96个桑色素的基因靶点,GeneCards、OMIM、DisGenet数据库预测得到7 122个COPD的基因靶点,取交集得到67个桑色素和COPD的共同作用基因靶点;拓扑学分析显示交集基因靶点中互作用较强的前5个基因靶点为SRC、MMP9、MMP2、PTGS2、FUR...