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基于GEO数据库研究缺氧肺癌中GBE1的表达和意义

安徽医科大学学报 2018 03 v.53 359-364     字体:

基金项目: 安徽省自然科学基金(编号:KJ2013Z108)

作者:丁翔;葛圣林;张朝东;

关键词:肺癌;;缺氧;;GBE1;;基因芯片

DOI:10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2018.03.006

〔摘 要〕 目的探讨糖原分支酶1(GBE1)在缺氧肺癌组织和细胞中的表达情况,评估其对肺癌缺氧耐受的意义,并探讨其影响肺癌凋亡的机制。方法通过GEO数据库下载含20例缺氧肺癌和常氧肺癌组织基因芯片的数据,结合GCBI平台,筛选差异基因进行GO和KEGG通路分析;体外培养A549细胞,敲降或高表达GBE1,缺氧处理后,MTT法检测细胞活力,Western blot和Real-time PCR检测凋亡相关基因的表达。结果 20例肺癌标本中,差异基因共206个,GBE1为差异最显著,GO及KEGG通路分析后发现差异基因涉及细胞周期、细胞代谢等多个通路;A549细胞缺氧处理后GBE1表达水平显著升高,敲降GBE1能显著增强A549细胞缺氧处理后细胞凋亡相关分子的表达,高表达GBE1能够抑制细胞凋亡相关分子的表达。结论 GBE1可能是潜在的造成肺癌缺氧耐受的分子标志物,为进一步研究肺癌的缺氧耐受机制提供参考。