基金项目: 浙江省公益技术应用研究计划项目(编号:LYY21H-310008);;浙江省医药卫生科技计划项目(编号:2022KY060、2023KY459、2023KY524)
作者:兰兰;宣自学;姜金颖;
关键词:FTO;;IFIT2;;肝细胞癌;;转录组测序;;HepG2;;m~6A
DOI:10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2024.05.014
〔摘 要〕 目的 初步研究脂肪量和肥胖相关蛋白(FTO)调控肝细胞癌(HCC)的分子机制。方法 构建FTO敲低的肝细胞癌细胞系HepG2细胞,收集FTO敲低的和未敲低的HepG2细胞,利用Illumina Hiseq平台进行高通量测序,筛选两组别间基因表达差异;通过对这些差异基因进行GO和KEGG富集分析,研究FTO调控通路及筛选FTO下游靶基因;利用生信分析和细胞实验揭示FTO下游靶基因在HCC中的作用。结果 转录组测序结果显示,FTO敲低的和未敲低的HepG2细胞间有386个基因发生了差异性表达,它们参与对干扰素-γ的反应等生物过程;FTO敲低后IFIT2(响应性最强的干扰素刺激基因之一)表达上调;IFIT2多个位点会发生潜在的m~6A甲基化;IFIT2高表达HCC患者生存期显著延长,敲低IFIT2促进HCC生长和迁移。结论 FTO可能通过介导m~6A调控IFIT2,进而促进HCC发生发展。