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基于炎症反应的阿尔茨海默症基因通路研究

安徽医科大学学报 2014 11 v.49 1534-1538     字体:

基金项目: 国家自然科学基金(编号:61271446、61003093);;上海市科委青年科技启明星计划(A类)(编号:11QA1402900)

作者:孔薇;张敬茂;牟晓阳;杨旸;

关键词:阿尔茨海默症;;基因表达数据;;蛋白质交互作用;;信号传导通路;;炎症反应

DOI:10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2014.11.003

〔摘 要〕 目的融合基因表达数据和蛋白质交互作用数据(PPI),同时考虑到炎症反应是阿尔茨海默症(AD)核心病理机制之一,构建基于炎症因子核因子-κB(NF-κB)的AD相关信号传导通路。方法首先,使用线性回归模型进行显著基因提取;然后,使用整数线性规划方法(ILP)融合基因表达数据和PPI数据,构建信号传导通路。结果得到以NF-κB为起点的预测通路,通路中包含6个已确定的AD致病基因,并探寻出与AD密切相关的T/B细胞受体信号通路,发现多个与炎症相关的基因。结论证明炎症反应是AD产生和发展的重要因素之一。