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利用高通量测序快速检测H7N9禽流感病毒及基因组序列分析

安徽医科大学学报 2014 08 v.49 1033-1038     字体:

基金项目: 国家高技术研究发展计划“863计划”(编号:2012AA022003);;“艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治”科技重大专项“十二五”实施计划(编号:2013ZX10004-605、2013ZX10004-217、2013ZX10004-607、2011ZX10004-001);“重大新药创制”科技重大专项“十二五”实施计划(编号:2011ZX09401-023);;国家自然科学基金(编号:81072350);;病原微生物生物安全国家重点实验室开放课题(编号:SKLPBS1113)

作者:裴广倩;范航;安小平;王伟;徐晓蒙;史套兴;童贻刚;

关键词:高通量测序;;H7N9禽流感病毒;;生物信息学分析

DOI:10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2014.08.002

〔摘 要〕 目的探索用高通量测序技术检测咽拭子样本中H7N9禽流感病毒的方法。方法分别提取编号为106、089及024 3份样本RNA,反转录,cDNA扩增,用Ion Torrent进行高通量测序,对测序结果进行生物信息学分析。结果 3个咽拭子样本的测序结果中均能检测出禽流感病毒,拼接出的基因组序列可以进行生物信息学分析。结论利用高通量测序技术可以快速地检测H7N9禽流感病毒,并可用生物信息学软件拼接基因组序列及进行序列分析。