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应用基因芯片技术筛选转染CDX2基因后胃癌细胞差异表达基因

安徽医科大学学报 2014 06 v.49 730-734     字体:

基金项目: 安徽省自然科学基金(编号:090413118)

作者:陈晓双;秦蓉;储婧;陈宗科;

关键词:胃肿瘤;;尾侧型同源转录因子-2;;基因芯片;;实时荧光定量PCR

DOI:10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2014.06.007

〔摘 要〕 目的观察转染CDX2基因后人胃癌细胞系BGC-823基因表达谱的变化。方法通过脂质体介导法转染pEGFP-C1-CDX2和空载体pEGFP-C1至人胃癌细胞系BGC-823中,经G418筛选后获得稳定转染细胞,逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)检测CDX2基因的表达。应用人类表达谱芯片Affymetrix 2.0对两组细胞同时进行基因芯片分析,筛选出差异表达基因(以表达差异≥2.0或≤0.5倍为限),选择部分差异表达基因进行实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(Real-time PCR)验证。结果基因芯片筛选出CDX2转染人胃癌细胞BGC-823差异表达基因599个,其中上调基因275个,下调基因324个,这些基因主要涉及细胞增殖、分化、凋亡、信号转导、蛋白酶活性、肿瘤侵袭和转移等方面;Real-time PCR检测部分差异表达基因DKK3、FOXP1、TWIST1、GATA6、RUNX3和BMP2,其结果与芯片结果一致,确定芯片结果可靠。结论应用人类表达谱芯片成功筛选出CDX2转染人胃癌细胞BGC-823后差异表达基因,为深入探讨CDX2在胃癌中的作用机制提供线索。