基金项目: 2023年贵州省国家级大学生创新创业训练计划项目(编号:202310662125);;贵州省科技计划项目(编号:黔科合基础-ZK[2023]一般428);;贵州中医药大学大学生创新创业训练计划项目[编号:贵中医大创合字(2023)30号];贵州中医药大学博士启动基金(编号:[2021]10号)~~
作者:姜运会;唐传铁;李军;张楠楠;
关键词:石斛碱;;糖尿病肾病;;HSP90AA1;;免疫细胞;;网络药理学;;生物信息学;;靶点
DOI:10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2024.09.015
〔摘 要〕 目的 运用网络药理学、生物信息学和Western blot探究石斛碱通过干预免疫治疗糖尿病肾病的作用机制。方法 通过Pharmmaper、Superpred等数据库筛选石斛碱的靶点,从GeneCards、OMIM等数据库筛选糖尿病肾病的疾病靶点,在Immport、InnateDB等数据库中检索免疫相关靶点,韦恩图获取上述三者之间的交集;STRING软件结合Cytoscape软件构建交集靶点的PPI图,使用CytoHubba插件挖掘互作网络中的核心靶点;从GEO获取数据集GSE142025,使用R语言CIBERSORT包进行免疫浸润和WGCNA分析;使用GSE1009、GSE30122和GSE142025进行基因差异表达分析和ROC验证,将关键靶点与免疫细胞表型进行相关性分析,并进行分子对接和分子动力学模拟分析;使用HK-2细胞进行Western blot实验检测HSP90AA1的表达。结果 共得到HSP90AA1、LCK、EGFR等128个交集基因,核心靶点涉及HSP90AA1、LCK和STAT3;分子对接及分子动力学模拟分析显示HSP90AA1的蛋白可以与石斛碱进行良好的结合;Western blot实验表明:与对照组相比,高糖组中HSP90AA1显著下调;与高糖组相比,给药组中HSP90AA1显著上调。结论 石斛碱可以通过调节HSP90AA1的表达从而干预糖尿病肾病。