〔摘　要〕 目的 筛选高耐药且高毒力耐甲氧西林金黄色葡萄球菌USA300(USA300)肺部感染过程中的自噬相关基因，探讨其分子机制，为免疫治疗靶点提供思路。方法 从GEO数据库获取USA300肺部感染小鼠模型数据集GSE220943，采用DESeq2筛选差异表达基因(DEGs)，结合MSigDB和Autophagy数据库获取自噬相关基因(ARGs)，通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)构建共表达模块，取与DEGs和ARGs的交集获得自噬相关基因。利用cluster Profiler R包进行基因本体(GO)富集分析，Metascape网站进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析，Immu Cell AI-mouse网站分析免疫浸润，String数据库构建蛋白-蛋白互作用(PPI)网络，Cytoscape软件拓扑分析筛选关键基因，并通过网站(https://www. bioinformatics. com.cn)绘制受试者工作特征曲线(ROC)曲线。最终通过实时荧光定量逆转录聚合酶链式反应(RT-qPCR)在小鼠肺组织中验证关键基因表达。结果 在感染后12、24、48、96 h分别筛选出6 135、4 075、3 680和2 342个DEGs，结合WGCNA和ARGs共筛选出19个自噬相关基因。GO和KEGG分析显示，这些基因参与CD4+T细胞激活调控、先天免疫反应、自噬小体膜等过程。免疫浸润分析发现，感染初期以中性粒细胞、树突细胞等先天免疫细胞为主，后期转向γδ T细胞、M2型巨噬细胞等细胞类型。PPI网络筛出12个核心自噬基因，进一步确定3个上调关键基因(Eif2ak2、Ikbke、Nfkbiz)，其ROC曲线下面积均为1.000。RT-qPCR验证显示，3个基因在感染24 h肺组织中表达升高(均P