〔摘　要〕 目的 针对国内艰难梭菌毒素B（TcdB）基因型的生物信息学分析，并通过原核表达制备TcdB，为有效疫苗的开发提供数据支持。方法 利用多个生物信息学软件，如Snippy，Blast，Muscle，R语言下的dist.alignment()函数与hclust()函数，对NCBI Genbank数据库中中国境内的1 355株艰难梭菌基因组进行比对、分析，构建系统发育树，并对其TcdB进行分群、建树。使用在线生物信息学分析网站，对占比最大的TcdB1与TcdB2亚群的代表性菌株的蛋白质结构及抗原表位进行预测并分析。通过构建重组质粒，使用原核表达系统，纯化抗原蛋白TcdB。结果 根据TcdB的基因型，国内1 355株艰难梭菌大抵上可分为12个亚型，以TcdB1与TcdB2为主要亚型，占所有分离得到的菌株数量的93.94%以上；约17.20%的菌株为非产毒菌株或缺乏TcdB，单独表达艰难梭菌毒素A。TcdB1与TcdB2的抗原表位分布基本一致，多分布于蛋白C端重复组合寡肽结构域外。结论 成功建立了一种专门针对国内TcdB的分型系统，可对其主要亚型的代表性菌株进行抗原表位的预测，并对筛选后的TcdB进行重组表达制备。