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不同来源的胰腺星状细胞CircRNA表达谱差异分析

安徽医科大学学报 2020 08 v.55 1209-1214     字体:

基金项目: 安徽省自然科学基金(编号:1608085QH197)

作者:蔡茗;邵峰;林先盛;陶冶;王思雨;黄强;

关键词:胰腺癌;;胰腺星状细胞;;环状RNA

DOI:10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2020.08.012

〔摘 要〕 目的以癌症相关胰腺星状细胞(CaPSCs)和正常胰腺相关胰腺星状细胞(NaPSCs)作为切入点,筛选出其影响胰腺癌细胞系Panc-1增殖和迁徙能力的相关circRNA,并以此探究胰腺癌靶向治疗的策略。方法分离培养出5个胰腺癌患者胰腺癌组织的CaPSCs_(1~5)和5个胰腺良性疾病患者的正常胰腺组织的NaPSCs_(1~5)后,再与Panc-1共培养,之后使用CCK-8实验检测Panc-1的增殖能力,筛选出对Panc-1增殖促进作用最强的CaPSCs_1和最弱的NaPSCs_1,再利用RNA高通量测序分析2种细胞间circRNA表达谱差异,并应用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证前3位差异性表达最明显的circRNA。同时利用KEGG富集差异circRNA的生物学过程及信号通路,并用microRNA靶标预测软件预测差异circRNA下游基因(microRNA)。结果与NaPSCs_1组比较,CaPSCs_1组有841个差异circRNA(其中下调的有453个,上调的有388个)、8 155个差异mRNA (其中下调的有4 226个,上调的有3 929个)及73个差异microRNA (其中下调的有16个,上调的有57个)。其中差异性表达最明显的circRNA为chr7:154954255|154998784、chr10:12081472|12120267和chr10:76909966|77019099,差异有统计学意义(P<0.05),其相对应的靶基因(microRNA)分别为hsa-miR-612、hsa-miR-1301-3p、hsa-miR-4459。差异circRNA主要富集的信号通路为Toll样受体信号通路、TNF信号通路、T细胞受体信号通路、HIF-1信号通路,生物过程则主要集中在细胞-底物连接和细胞-基质黏附连接等方面。结论 CaPSCs中表达上调最明显的circRNA:chr7:154954255|154998784、chr10:12081472|12120267和chr10:76909966|77019099及其下游靶基因(microRNA)有可能与PSCs通过多种信号通路促进胰腺癌细胞增殖和迁徙的能力相关。