基金项目: 国家自然科学基金(编号:81372577);;新世纪优秀人才支持计划(编号:NCET-13-0644);;安徽省皖江学者计划;;2016年度省学术和技术带头人后备人选科研活动经费资助(编号:2016H073)
作者:郑俊俊;毛玉娣;汪朝靓;殷实;王华;
关键词:结肠癌;;mircoRNA;;异常表达;;基因表达谱;;靶基因
DOI:10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2019.03.003
〔摘 要〕 目的研究结肠癌组织中微小RNA(miRNA)表达谱的变化。方法收集5例结肠癌和5例癌旁组织进行miRNA基因芯片检测,从中筛选出异常表达的miRNA。通过生物信息学分析的方法对差异性表达miRNA所调控的靶基因、富集的生物过程和信号通路进行分析。结果通过Affymetrix miRNA4.0芯片检测,共筛选出73个差异性表达的miRNA,并对变化最明显的前13个上调及前13个下调的基因进行总结,其中包括hsa-miR-183-3p、hsa-miR-224-5p、hsa-miR-99a-5p等新的结肠癌相关基因。此外,生物信息学分析显示了差异性表达miRNA所调控的靶基因以及其所代表的生理意义,如蛋白质修饰过程、Wnt信号通路、癌症相关通路、翻译后蛋白质修饰、RAS信号通路、TP53转录调控等。结论检测结肠癌组织中miRNA表达谱的变化,对探讨结肠癌发病机制,寻找早期诊断和预后标志物,扩展治疗策略提供新的视野。