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秀丽线虫野生株系N2缺氧的荧光定量蛋白质组学研究

安徽医科大学学报 2013 11 v.48 1292-1296     字体:

基金项目: 国家自然科学基金(编号:81100862)

作者:李华玲;孔玲;秦艳;刘丹丹;夏靖;胡竹林;陈文飞;

关键词:秀丽线虫;;野生株系(N2);;荧光定量蛋白质组学;;过氧还蛋白

DOI:10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2013.11.002

〔摘 要〕 目的研究秀丽线虫野生株系N2缺氧时的差异蛋白质,为进行线虫在缺氧环境下的应答机制研究奠定基础。方法同步化培养N2株系的线虫,培养至L4期时物理缺氧10 h(0.2%O2)后,提取总蛋白,采用双向荧光差异凝胶电泳(DIGE)分离和串联质谱分析,搜索线虫数据库,鉴定蛋白种类并进行分析。并采用突变株系(prdx-2,prdx-3)进行了4、6、8、10、12 h的缺氧实验研究。结果质谱成功鉴定了其中的5个与对照有显著差异的蛋白质(ratio>2.0,P<0.05),包括2个上调(PRDX-2、PRDX-3)和3个(RPL-7、H28O16.1、VHA-12)下调的蛋白。突变株系的缺氧存活率实验进一步验证了蛋白质组学的结果,也显示了PRDX-2和PRDX-3在抗缺氧中起重要作用。结论蛋白质组学的方法为线虫缺氧的研究提供了有参考价值的数据,缺氧10 h后,线虫中变化的蛋白质与能量、翻译和抗氧化有关,为进一步研究缺氧时的应答机制奠定了基础。